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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
渝湘高铁重黔段白木沟双线特大桥合龙******
中新网重庆1月11日电 (张旭)记者从渝黔铁路有限责任公司获悉，1月11日，渝湘高铁重庆至黔江段白木沟双线特大桥顺利完成合龙浇筑施工。
图为工人正在作业。 渝黔铁路有限责任公司供图白木沟双线特大桥全长570.2米，连接陈家院子隧道和白马山隧道，由中铁二院设计，中铁七局承建。
据介绍，受西南山区地质结构影响，该桥采用异形结构设计，含有1孔24米桥梁、11孔32米桥梁和一座48米+80米+48米的连续刚构桥等组成部分。
图为渝湘高铁重黔段白木沟双线特大桥。 渝黔铁路有限责任公司供图本次合龙的是48米+80米+48米连续刚构桥梁，合龙段长2米，桥面宽12.6米，浇筑混凝土42.52立方米，耗时两个多小时。此次合龙，也标志着全桥的合龙。
合龙后，后续施工将继续推进。施工方中铁七局介绍，为确保按期完成建设任务，项目部提前安排员工进行了调休，春节期间将不停工。
图为渝湘高铁重黔段白木沟双线特大桥施工现场。 渝黔铁路有限责任公司供图渝湘高铁重庆至黔江段是中国“八纵八横”高速铁路网规划中厦渝通道的重要组成部分。项目建成后，重庆黔江至主城区的旅行时间将从现在的4小时缩短至1小时以内，极大改善沿线居民的出行条件。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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